Cerebria er et dynamisk, holdbaseret, målstyret områdekontrolspil, hvor spillerne spiller som ånder, magtfulde enheder, der repræsenterer Bliss eller Gloom. Disse modsatrettede kræfter - de to sider af den menneskelige natur - kæmper for at kontrollere og forme den indre verden, den metaforiske repræsentation af en personlighed i udvikling.
Cerebria introducerer et unikt tema og adskillige innovative mekanismer. Spillet er centreret omkring de spillerstyrede ånder og de Emotion-kort, der styrer Cerebrias områder, hver med deres egen statistik og evner.
Ånderne kan udføre op til tre handlinger på deres tur. De kan bevæge sig mellem Cerebrias riger og grænser, bruge de specifikke kræfter i rigerne, påkalde og opgradere Emotion-kort, fjerne modstridende Emotioner og bygge fæstninger for at konsolidere deres indflydelse på bestemte områder. Handlingerne koster viljestyrke, som primært opnås ved at absorbere fra Origin's Spheres i midten af spillepladen. Både Bliss og Gloom har også en sjælden fælles holdressource, Ambition, som gør dem i stand til at bruge spillets mest kraftfulde effekter.
Holdene kan score point enten ved at opfylde offentligt kendte mindre mål (intentionerne) eller ved at opfylde deres større mål (ambitionerne), som ændrer sig dynamisk i løbet af spillet. Ved at score Aspirations kan spillerne tilføje Bliss- og Gloom-fragmenter til Identity, der er bygget i midten af brættet. Det er vigtige øjeblikke i spillet: Cerebrias tilstand er i konstant forandring, men fragmenterne er permanente aftryk af en spiltilstand under scoringsbegivenhederne.
Spillet vindes af den side, der har størst indflydelse på den færdige Identitet, og som dermed bliver den dominerende kraft i Cerebria.