To rivaliserende spionmestre kender de hemmelige identiteter af 25 agenter. Deres holdkammerater kender kun agenterne ved deres KODENAVNE.
I Codenames: Deep Undercover konkurrerer to hold om at kontakte alle deres agenter først. Spionmestre giver ét-ords ledetråde, der kan pege på flere ord på brættet. Deres holdkammerater forsøger at gætte ord af den rigtige farve, mens de undgår dem, der tilhører det modsatte hold. Og alle ønsker at undgå attentatmanden.
Codenames: Deep Undercover kan spilles som et selvstændigt spil eller kombineres med andre Codenames-titler.